学校结合现代教育理念和实践经验,提出了旨在锻造综合素质能力强的复合型人才的“一二三六十”学生素质教育体系。学校始终坚持把转变教育思想、更新教育观念放在首位,树立了“学生为本,德育为先,开拓创新,全面育人”的教育新理念,武装和建设好学生政工干部和学生干部这两支队伍,建设信息反馈系统、和谐安全维稳系统、应急处理系统“三”个系统,推进观念创新、课堂教学创新、载体创新、思路创新、方法创新、机制创新“六”个创新,打造党旗飘扬工程、修身立德工程、厚德载物工程、学海竞舟工程、素质拓展工程、春风化雨工程、扶困助心工程、和谐校园工程、青春扬帆工程、硕果荟萃工程“十”大工程。
通过构建学生素质教育新体系,广东药学院在培养综合素质能力强的复合型人才方面取得了良好的成效。广东药学院建成国家级大学生文化素质教育基地;2005至2007年,学生科技立项连续三年连年翻番。近年来,获全国、省各类学术科技创新奖项近50项;在全国和广东省“挑战杯”大赛中,共获国家级和省级奖励56项;在省“挑战杯”大学生创业计划作品竞赛共获金奖2项、银奖13项、铜奖25项,2006年因成绩突出被授予大赛“优秀组织奖”荣誉称号;2006年首次参加“高教社杯”全国大学生数学建模竞赛,荣获全国一等奖、广东省一等奖等6个奖项;首次参加2006年“CCTV杯”全国英语演讲大赛获广东赛区第三名。2007年首次参加全国电子设计大赛,获省赛区二、三等奖。学校在国际和国内有关体育比赛中先后取得了不斐的成绩:参加亚洲级别比赛一次,在1项获奖项目中名列第七名;参加全国级别的单项和综合比赛获得金牌5枚、银牌9枚、铜牌8枚;参加省级比赛获金牌12枚、银牌22枚、铜牌21枚。学院高水平运动队健儿在2006年亚洲及太平洋地区定向锦标赛中,首次出征世界级比赛就取得排位赛第25名的佳绩,为国家争得了荣誉。